Berthold Büchele hat zwei musikalische Forschungsschwerpunkte:
1. Erforschung, Edition und Wiederaufführung oberschwäbischer Musik in folgenden Bereichen:
1.1. Klöster (geistliche, weltliche Musik)
1.2. Adelshöfe (Instrumental- und Vokalmusik)
1.3. Reichsstädte (Instrumental- und Vokalmusik)
1.4. Dörfer (Volkslieder, Tänze)
2. Erforschung und Wiederaufführung unbekannter Oratorien des 19. Jahrhunderts (Schwerpunkt Frankreich)
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